氧化亞鐵鉤端螺旋菌的固氮供硫蛋白與底物的相互作用

氧化亞鐵鉤端螺旋菌的固氮供硫蛋白與底物的相互作用

氧化亞鐵鉤端螺旋菌的nifS基因可能在它的固氮酶成熟中發揮重要的作用.為了考察由這個基因編碼的蛋白質,建立了一個關于它的可靠的完整三維分子結構.建立的結構被進一步進行綁定位點搜索,跟輔因子磷酸吡哆醛(PLP)和底物半胱氨酸進行柔性分子對接,并據此識別其關鍵殘基.在跟半胱氨酸對接中,半胱氨酸中的氨基非常靠近His102,Lys204和PLP,半胱氨酸跟它們的相互作用能也很大,這些情況跟那些來自其他生物的固氮供硫蛋白(NifS)類似物的實驗事實一致.根據這些結果,這個基因編碼NifS;底物半胱氨酸能被有效地募集到激活位點.

作 者： 劉元東 劉楚干 李琳 鄒俐宏 劉學端 邱冠周 LIU Yuan-dong LIU Chu-gan LI Lin ZOU Li-heng LIE Xue-duan QIU Guan-zhou   作者單位： 劉元東,鄒俐宏,劉學端,邱冠周,LIU Yuan-dong,ZOU Li-heng,LIE Xue-duan,QIU Guan-zhou(中南大學資源加工與生物工程學院,中國長沙,410083)

劉楚干,LIU Chu-gan(湖南省新寧縣崀山鎮中心小學,中國邵陽,422702)

李琳,LI Lin(中南林業科技大學電子與信息工程學院,中國長沙,410004) 

刊 名： 湖南師范大學自然科學學報  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF NATURAL SCIENCE OF HUNAN NORMAL UNIVERSITY  年，卷(期)： 2008 31(3)  分類號： O726  關鍵詞： 固氮供硫蛋白(NifS)   氧化亞鐵鉤端螺旋菌   同源建模   分子動力學   分子對接   磷酸吡哆醛(PLP)   半胱氨酸  

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