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抑制劑 BD2對PKA與PKCβⅡ的抑制選擇性研究
蛋白激酶A(PKA)和蛋白激酶C(PKC)的過度表達導致細胞生長分化異常,是治療腫瘤的潛在靶點.抑制劑BD2對PKA和PKC抑制作用存在高選擇性.為了探討BD2高選擇性機制,本工作以PKA與BD2復合物的晶體結構為模板,通過同源模建結合分子對接的方法構建PKC βⅡ與BD2復合物的結構,并對PKA-BD2復合物和PKC-BD2復合物進行了2.5 ns的分子動力學模擬,運用MM-GBSA方法計算了結合自由能,通過能量分解的方法考察PKA和PKC的主要殘基與BD2之間的相互作用和識別機制.結合能分析結果很好地描述了BD2對PKA抑制活性比其對PKC抑制活性高這一實驗現象.氫鍵分析和能量分解結果共同說明了BD2的B環和酰胺鏈部分與PKA和PKC中相應位點的殘基之間的相互作用存在差異,這是BD2存在選擇性的內在因素.BD2高選擇性作用機制的闡明為進一步基于結構的balanol類抑制劑的結構設計和優化提供了合理的指導.
吳天星,Wu,Tianxing(浙江大學化學系,杭州,310027)
蔣勇軍,鄒建衛,Jiang,Yongjun,Zou,Jianwei(浙江大學寧波理工學院分子設計與營養工程市重點實驗室,寧波,315100)
刊 名： 化學學報 ISTIC SCI PKU 英文刊名： ACTA CHIMICA SINICA 年，卷(期)： 2009 67(13) 分類號： O6 關鍵詞： 蛋白激酶A(PKA) 蛋白激酶C(PKC) 同源模建 分子對接 分子動力學模擬 抑制選擇性【抑制劑 BD2對PKA與PKCβⅡ的抑制選擇性研究】相關文章：
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