黃瓜CsEXP 10基因的電子克隆及生物信息學分析

黃瓜CsEXP 10基因的電子克隆及生物信息學分析

以黃瓜CsEXP10 cDNA片段為信息探針,利用電子克隆和序列拼接方法獲得了1191bp的cDNA序列.應用生物信息學軟件預洲了該蛋日的理化性質、卷曲螺旋、疏水性、信號肽、跨膜結構、糖基住點、活性位點、亞細胞定位及二級和高級結構.結果表明:該蛋白是一個疏水性穩定蛋白,定位于細胞壁,含有4個α-螺旋,11個β-折疊,5個跨膜區域,10個糖基化位點,具有催化域和多糖結合域兩個結構域.

作 者： 孫涌棟 張傳來 羅未蓉 張興國 SUN Yong-dong ZHANG Chuan-lai LUO Wei-rang ZHANG Xing-guo   作者單位： 孫涌棟,張傳來,羅未蓉,SUN Yong-dong,ZHANG Chuan-lai,LUO Wei-rang(河南科技學院園林學院,新鄉,453003)

張興國,ZHANG Xing-guo(西南大學園藝園林學院,重慶,400715) 

刊 名： 生物信息學  ISTIC 英文刊名： CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS  年，卷(期)： 2008 6(3)  分類號： Q343.1  關鍵詞： 黃瓜   CsEXP10基因   電子克隆   生物信息學  

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