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暗紋東方鲀線粒體COI及其側翼tRNA基因的克隆與序列分析
以暗紋東方鲀(Takifugu fasciatus)肝臟的線粒體DNA為模板,按照紅鰭東方鲀線粒體DNA序列設計合成特異引物進行PCR擴增,克隆并測定了線粒體細胞色素氧化酶I亞基(COI)及其側翼tRNA基因的全序列,結果顯示,克隆了暗紋東方鲀COI基因1 546 bp及其5′端上游的tRNATyr基因和3′端下游的tRNASer基因序列共1 766 bp.用DNA分析軟件對暗紋東方鲀與GenBank中10個目14種魚類的COI序列進行比較分析,顯示暗紋東方鲀與這些魚類的COI基因具有較高的同源性,與同屬紅鰭東方鲀的同源性最高為97.6%,與同目不同科的矛尾翻車鲀和翻車鲀的同源性為76.5%和75.4%.根據暗紋東方鲀與其他1 314種魚的COI基因序列同源性所建立的進化樹,與傳統的分類地位基本吻合.推定的這兩種tRNA的二級結構都具有典型的三葉草型結構.
作 者: 邵愛華 朱江 陳葵 史全良 姚煒雯 SHAO Ai-Hua ZHU Jiang CHEN Kui SHI Quan-Liang YAO Wei-Wen 作者單位: 邵愛華,SHAO Ai-Hua(江蘇省蘇州大學生命科學學院,蘇州,215123;江蘇省蘇州科技學院生物學系,蘇州,215009)朱江,陳葵,史全良,姚煒雯,ZHU Jiang,CHEN Kui,SHI Quan-Liang,YAO Wei-Wen(江蘇省蘇州大學生命科學學院,蘇州,215123)
刊 名: 遺傳 ISTIC PKU 英文刊名: HEREDITAS(BEIJING) 年,卷(期): 2006 28(8) 分類號: Q95 關鍵詞: 暗紋東方鲀 線粒體DNA COI 系統學【暗紋東方鲀線粒體COI及其側翼tRNA基因的克隆與序列分析】相關文章:
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