粘質(zhì)沙雷氏菌幾丁質(zhì)酶(ChiC)基因克隆及其生物信息學(xué)分析

粘質(zhì)沙雷氏菌幾丁質(zhì)酶(ChiC)基因克隆及其生物信息學(xué)分析

從粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescens ATCC14041)中克隆出幾丁質(zhì)酶基因(ChiC),將回收純化的PCR產(chǎn)物與載體pMD18-T連接,構(gòu)建成的重組質(zhì)粒命名為pMD-ChiC,將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到受體E.coli DH5α中進(jìn)行克隆,經(jīng)BamHⅠ和Nhe Ⅰ雙酶切驗證、核酸序列測定證實,重組質(zhì)粒pMD-ChiC含有幾丁質(zhì)酶C基因(ChiC).利用生物信息學(xué)的方法,推測該粘質(zhì)沙雷氏菌ChiC基因編碼的蛋白質(zhì)由480個氨基酸組成.預(yù)測該蛋白的等電點為5.63,分子量約為52kD.針對粘質(zhì)沙雷氏菌中的幾個幾丁質(zhì)酶基因做了進(jìn)化樹,進(jìn)而驗證了粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescens)幾丁質(zhì)酶(ChiC)在沙雷氏菌幾丁質(zhì)酶中的分類;同時對粘質(zhì)沙雷氏菌幾丁質(zhì)酶C(ChiC)蛋白的高級結(jié)構(gòu)作出了預(yù)測,得到其編碼的屬于18家族的蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)圖譜.

作 者： 魏巍 賀淹才 方柏山 劉愛花 WEI Wei HE Yan-cai FANG Bai-shan LIU Ai-hua   作者單位： 華僑大學(xué),生物工程系,福建,泉州,362021  刊 名： 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS  年，卷(期)： 2006 28(3)  分類號： Q813.2  關(guān)鍵詞： 幾丁質(zhì)酶ChiC基因   粘質(zhì)沙雷氏菌   基因克隆   生物信息學(xué)分析  

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