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動態性狀基因座的復合區間定位
動態性狀因其廣泛性和重要性而備受動植物遺傳育種研究者關注.用分子遺傳學方法探索該類性狀的遺傳機制已成為一個極富挑戰性的研究課題.將關于時間(測定日期)的Legendre多項式鑲嵌在遺傳模型的每個遺傳效應中,以刻畫QTL和協同因子對動態性狀變化過程的作用,從而建立動態性狀基因復合區間定位分析的數學模型.利用復合區間定位策略的優勢,提高對控制動態性狀多個QTL的檢測效力.以F2設計群體為例,闡述了動態性狀基因復合區間定位的似然分析原理,推導了參數似然估計的EM法兩步求解過程.模擬實驗證明,相同設計條件下,復合區間定位對分布在同一連鎖群上多個影響動態性狀QTL的檢測效果明顯好于區間定位;隨著協同因子數目的增加,復合區間定位不但能檢測出更多的甚至所有的QTL,而且對每個QTL分辨得更加清楚.在實際應用過程中,應針對動態性狀的變化規律,并考慮計算成本恰當地選擇協同因子數目.
作 者: 高會江 楊潤清 作者單位: 高會江(東北農業大學動物科學技術學院,哈爾濱,150030)楊潤清(上海交通大學農業與生物學院,上海,200240)
刊 名: 科學通報 ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE SCIENCE BULLETIN 年,卷(期): 2006 51(13) 分類號: Q3 關鍵詞: 動態性狀 復合區間定位 Legendre多項式 極大似然估計 EM算法【動態性狀基因座的復合區間定位】相關文章:
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