用Taqman MGB探針研究中國人群TNF-α基因啟動子區單核苷酸多態

用Taqman MGB探針研究中國人群TNF-α基因啟動子區單核苷酸多態性

[目的]了解中國人群腫瘤壞死因子α(the tumour necrosis factor α,TNF-α)基因啟動子區多態性.[方法]隨機選取20名深圳地區漢族健康體檢者,采用兩對引物PCR擴增TNF-α基因啟動子區(-1389nt～+125 nt),對PCR產物進行序列分析,尋找單核苷酸多態性位點(single nucleotide polymorphisms,SNPs).采用Taqman MGB探針建立了-857nt(C/T)位點的實時定量PCR(the real-time PCR)分型方法,并對中國漢族、壯族、布依族,水族及苗族群體共1 108份樣本進行了基因分型.[結果]在啟動子區(-1322nt～+67 nt),發現6個SNP位點,即-885(A/G)、-863(C/A)、-646(G/A)、-648(G/A)、-568(G/C)和-857(C/T,其中位點-646 nt(G→A)為新發現SNP.-885、-648及-568nt位點堿基雖然與Genbank不同,但測序的20個個體基因分型相同.中國人群-857nt(C/T)位點基因型頻率分別為0.79(CC),0.19(CT)和0.02(TT),中國漢族、壯族、布依族,水族及苗族群體間無顯著性差異.中國人群-857T等位基因頻率為0.116,與文獻報道的韓國人群相同,但比日本人群低.[結論]中國人群TNF-α基因啟動子區單核苷酸多態性可能較保守.采用Taqman MGB探針實時定量PCR技術對SNPs進行基因分型簡便、快速及準確,易于自動化,為大規模的疾病相關性研究提供了有效的工具.

作 者： 庾蕾 莊志雄 謝富煥 黃海雄 葉小明 YU Lei ZHUANG Zhi-xiong XIE Fu-huan HUANG Hai-xiong YE Xiao-ming   作者單位： 深圳市疾病預防控制中心食品/毒理科,廣東,深圳,518020  刊 名： 中山大學學報（醫學科學版）  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF SUN YAT-SEN UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES)  年，卷(期)： 2006 27(1)  分類號： Q347  關鍵詞： 多態性   腫瘤壞死因子α   單核苷酸多態性   實時定量PCR   Taqman MGB探針  

【用Taqman MGB探針研究中國人群TNF-α基因啟動子區單核苷酸多態】相關文章：

重慶地區人群HLA-A、B、DRB1基因多態性研究04-26

人偏肺病毒TaqMan-MGB探針實時定量RT-PCR檢測方法的建立及初步應用04-26

單核苷酸多態性檢測方法的研究進展04-26

秦巴山區漢族人群DXS8027基因座的多態性分布研究04-26

豬PGC1基因PCR-RFLP多態性研究04-27

安徽地區漢族人群15個STR基因座遺傳多態性04-26

閩南地區漢族人群12個Y-STR基因座遺傳多態性04-26

人工神經網絡在單核苷酸多態性(SNP)檢測中的應用04-26

新生隱球菌莢膜相關基因CAP10啟動序列的活性研究04-26

中國人類基因組研究的現在與未來04-26