豬T細胞受體γ鏈基因的克隆及生物信息學分析

豬T細胞受體γ鏈基因的克隆及生物信息學分析

目的:克隆豬T細胞受體γ鏈(pTCR-γ)基因,用以研究豬T細胞受體分子結構與功能.方法與結果:以GenBank上登載的pTCR-γ基因為參考序列,用RT-PCR法從豬外周血淋巴細胞中克隆pTCR-γ基因.序列分析表明,pTCR-γ基因開放讀框為1026 bp,編碼341個氨基酸殘基,合有由23個氨基酸殘基構成的信號肽序列;與參考序列相比,在核苷酸和推導氨基酸序列上的同源性分別為95.6%和88.8%;系統進化分析發現,該基因與綿羊、恒河猴、人、馬、牛的同源性相對較高,與褐鼠、家犬、家鼠、家貓的同源性次之,而與禽類、魚類的同源性最低;生物信息學結構預測表明豬T細胞受體γ鏈含2個結構域,其中1個為IG_LIKE1結構域(IGv結構域),由第14～114位共101個氨基酸殘基組成;另一個為IG_LIKE2結構域(IGc結構域),由第143～238位共96個氨基酸殘基組成.結論:克隆并應用生物信息學技術分析了豬T細胞受體γ鏈基因序列及編碼蛋白的結構特征,為進一步研究γ鏈的結構與功能奠定了基礎.

作 者： 李玩生 房永祥 曾爽 景志忠 LI Wan-Sheng FANG Yong-Xiang ZENG Shuang JIHG Zhi-Zhong   作者單位： 中國農業科學院,蘭州獸醫研究所家畜疫病病原生物學國家重點實驗室,農業部獸醫公共衛生重點實驗室,甘肅省動物寄生蟲病重點實驗室,甘肅,蘭州,730046  刊 名： 生物技術通訊  ISTIC 英文刊名： LETTERS IN BIOTECHNOLOGY  年，卷(期)： 2010 21(2)  分類號： Q78  關鍵詞： 豬T細胞受體γ鏈   基因克隆   生物信患學   結構預測  

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