大白菜蘋果酸脫氫酶基因的克隆及序列分析

大白菜蘋果酸脫氫酶基因的克隆及序列分析

首先以一個用cDNA-AFLP分析大白菜[Brassica campestris L.ssp.pekinensis(Lour.)Olsson]雄性不育花蕾敗育得到的差異表達片段(TDF,Transcript Derived Fragments)EST54-1為信息探針,在Gen-Bank數(shù)據(jù)庫中進行同源EST序列檢索,并對親緣關(guān)系近的同源EST序列進行拼接,獲得長度為1 574 bp的虛擬序列.然后設(shè)計引物,經(jīng)RT-PCR擴增、測序,獲得丫大白菜蘋果酸脫氫酶基因的cDNA全長序列,并已將其登錄到GenBank,登錄號:FJ208590,該cDNA全長1 209 bp,編碼403個氨基酸.同源分析顯示該cDNA與電子克隆獲得的核酸序列99%同源,該cDNA序列推導(dǎo)的氨基酸序列與擬南芥蘋果酸脫氫酶同源性100%.雖然在大白菜花蕾敗育過程中蘋果酸脫氫酶基因mRNA表達量下降,但其與大白菜花蕾敗育的關(guān)系還需通過RNA干擾等技術(shù)進行驗證.

作 者： 賈晉 張魯剛 JIA Jin ZHANG Lu-gang   作者單位： 賈晉,JIA Jin(西北農(nóng)林科技大學(xué)園藝學(xué)院,陜西,楊凌,712100;內(nèi)蒙古科技大學(xué)生物與化學(xué)工程學(xué)院,內(nèi)蒙古,包頭,014010)

張魯剛,ZHANG Lu-gang(西北農(nóng)林科技大學(xué)園藝學(xué)院,陜西,楊凌,712100) 

刊 名： 園藝學(xué)報  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA HORTICULTURAE SINICA  年，卷(期)： 2009 36(3)  分類號： S634.1  關(guān)鍵詞： 大白菜   花蕾敗育   電子克隆   RT-PCR   蘋果酸脫氫酶  

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